Setelah kelulusannya, Marie Thomas kemudian memulai prakteknya di rumah sakit utama di Batavia bernama Centrale Burgerlijke Ziekeninrichting (CBZ) (sekarang Rumah Sakit Umum Pusat Nasional Dr. Cipto Mangunkusumo).
Selain itu, dia juga kemudian bekerja di beberapa kota di Indonesia seperti Medan, Manado, dan kembali ke Batavia dan bekerja di Rumah Sakit Budi Kemuliaan yang didirikan oleh yayasan SOVIA.
Pada 16 Maret 1929, Marie menikah dengan Mohammad Joesoef yang juga merupakan seorang dokter. Mereka kemudian pindah ke Padang di Sumatra Barat tempat asal suaminya itu.
Di Padang, Marie mengambil jabatan di Layanan Kesehatan Masyarakat (DVG atau Dienst der Volksgezondheid).
Setelah kepindahannya dari Padang ke Batavia, Marie terlibat dengan partai Persatuan Minahasa di mana Sam Ratulangi juga menjadi anggota.
Dan pada tahun 1950, ia mendirikan sekolah kebidanan di Bukittinggi, yang merupakan yang pertama di Sumatra dan yang kedua di Indonesia.
Hingga akhirnya Marie Thomas wafat pada tanggal 10 oktober 1966 dalam umur 70 tahun di Bukittinggi, Sumatra Barat.* * *