Saat Habibie menjabat, kebebasan membuat parta politik (parpol) diterapkan pada pemilu tahun 1999.
Alhasil, banyak partai baru bermunculan dengan beragam ideologi dan latar belakang selain komunisme.
Pemilu tersebut diikuti oleh 48 parpol. dan Golkar untuk pertama kalinya sejak Soeharto menjabat, kalah dari PDI-P.***