Terdapat dunia cahaya dan kegelapan dalam Alchemy Stars, namun keduanya bertabrakan ketika Aurorian dan Caelestites, yang hidup damai di tanah Astra selama ratusan tahun dipaksa untuk menghadapi organisasi misterius yang mengendalikan makhluk iblis, yang dikenal sebagai Eclipsites, untuk memusnahkan Caelestites.
Mereka yang selamat dari serangan harus hidup dalam pengasingan, sampai seorang Aurorian datang dan membawa para Caelestites kembali ke permukaan untuk memulai petualangan epik dan menciptakan sebuah legenda baru.
Ragam hero dan desain karakter yang estetik juga menjadi daya tarik lain dari Alchemy Stars.
Masing-masing hero memiliki kepribadian unik sendiri yang ditampilkan melalui model karakter, pakaian, dan animasi pertempuran yang menakjubkan.***